MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl15

Total Repeats: 446

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011226	TTTTTA	2	12	59	70	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011226	TTA	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011226	TA	3	6	85	90	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011226	TA	3	6	111	116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011226	ATAC	2	8	145	152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011226	TA	3	6	224	229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011226	AGT	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283913
8	NC_011226	GGAT	2	8	305	312	25 %	25 %	50 %	0 %	203283913
9	NC_011226	TAC	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283913
10	NC_011226	AAT	2	6	418	423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283913
11	NC_011226	ATA	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283913
12	NC_011226	ATT	2	6	499	504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283913
13	NC_011226	ATA	2	6	551	556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283913
14	NC_011226	ATT	2	6	565	570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283913
15	NC_011226	AAATTA	2	12	664	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283913
16	NC_011226	AAT	2	6	676	681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283913
17	NC_011226	TAT	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283913
18	NC_011226	AAT	2	6	738	743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283913
19	NC_011226	AAT	2	6	807	812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011226	TAG	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283914
21	NC_011226	TGC	2	6	901	906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203283914
22	NC_011226	TGCTTG	2	12	910	921	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	203283914
23	NC_011226	TTG	2	6	925	930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283914
24	NC_011226	TTC	2	6	940	945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283914
25	NC_011226	TGAT	2	8	991	998	25 %	50 %	25 %	0 %	203283914
26	NC_011226	T	6	6	1034	1039	0 %	100 %	0 %	0 %	203283914
27	NC_011226	A	6	6	1091	1096	100 %	0 %	0 %	0 %	203283914
28	NC_011226	ATAC	2	8	1215	1222	50 %	25 %	0 %	25 %	203283914
29	NC_011226	ATC	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283914
30	NC_011226	TCA	2	6	1271	1276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283914
31	NC_011226	T	8	8	1277	1284	0 %	100 %	0 %	0 %	203283914
32	NC_011226	ATCT	2	8	1320	1327	25 %	50 %	0 %	25 %	203283914
33	NC_011226	TAAA	2	8	1333	1340	75 %	25 %	0 %	0 %	203283914
34	NC_011226	TCT	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283914
35	NC_011226	TC	3	6	1379	1384	0 %	50 %	0 %	50 %	203283915
36	NC_011226	T	6	6	1406	1411	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
37	NC_011226	GTT	2	6	1477	1482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283915
38	NC_011226	CGG	2	6	1518	1523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	203283915
39	NC_011226	CT	3	6	1549	1554	0 %	50 %	0 %	50 %	203283915
40	NC_011226	CAC	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203283915
41	NC_011226	TCT	2	6	1630	1635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283915
42	NC_011226	TCT	3	9	1663	1671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283915
43	NC_011226	TCTT	2	8	1692	1699	0 %	75 %	0 %	25 %	203283915
44	NC_011226	TTC	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283915
45	NC_011226	TA	3	6	1725	1730	50 %	50 %	0 %	0 %	203283915
46	NC_011226	TTG	2	6	1734	1739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283915
47	NC_011226	TCTTTT	2	12	1777	1788	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203283915
48	NC_011226	T	8	8	1785	1792	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
49	NC_011226	CTT	3	9	1793	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283915
50	NC_011226	T	6	6	1813	1818	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
51	NC_011226	T	6	6	1856	1861	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
52	NC_011226	GTC	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203283915
53	NC_011226	TCTTT	2	10	1966	1975	0 %	80 %	0 %	20 %	203283915
54	NC_011226	TCA	3	9	1976	1984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283915
55	NC_011226	TATG	2	8	2103	2110	25 %	50 %	25 %	0 %	203283915
56	NC_011226	GTT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283915
57	NC_011226	T	6	6	2222	2227	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
58	NC_011226	CAC	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203283915
59	NC_011226	TTTA	2	8	2301	2308	25 %	75 %	0 %	0 %	203283915
60	NC_011226	TAA	2	6	2330	2335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283915
61	NC_011226	GTT	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283915
62	NC_011226	T	7	7	2395	2401	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
63	NC_011226	T	6	6	2408	2413	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
64	NC_011226	ATG	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283915
65	NC_011226	ATA	2	6	2586	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283915
66	NC_011226	TTCCTT	2	12	2600	2611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283915
67	NC_011226	TTA	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283915
68	NC_011226	GTT	2	6	2649	2654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283915
69	NC_011226	TAG	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283915
70	NC_011226	T	7	7	2694	2700	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
71	NC_011226	GCA	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203283915
72	NC_011226	TAA	2	6	2715	2720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283915
73	NC_011226	T	6	6	2732	2737	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
74	NC_011226	TTC	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203283915
75	NC_011226	ATTG	2	8	2770	2777	25 %	50 %	25 %	0 %	203283915
76	NC_011226	TATT	2	8	2798	2805	25 %	75 %	0 %	0 %	203283915
77	NC_011226	ATT	2	6	2821	2826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283915
78	NC_011226	ATT	2	6	2851	2856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283915
79	NC_011226	TAT	2	6	2891	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283915
80	NC_011226	ATTT	2	8	2943	2950	25 %	75 %	0 %	0 %	203283915
81	NC_011226	ATT	3	9	2976	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283915
82	NC_011226	T	8	8	3013	3020	0 %	100 %	0 %	0 %	203283915
83	NC_011226	T	6	6	3040	3045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011226	TAT	2	6	3075	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011226	AT	3	6	3079	3084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011226	T	7	7	3123	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011226	A	6	6	3133	3138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011226	ATATA	2	10	3208	3217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011226	TAA	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283916
90	NC_011226	AT	3	6	3264	3269	50 %	50 %	0 %	0 %	203283916
91	NC_011226	AAGA	2	8	3348	3355	75 %	0 %	25 %	0 %	203283916
92	NC_011226	TTA	2	6	3356	3361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283916
93	NC_011226	T	7	7	3488	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	203283916
94	NC_011226	A	6	6	3504	3509	100 %	0 %	0 %	0 %	203283916
95	NC_011226	TAA	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283916
96	NC_011226	A	7	7	3580	3586	100 %	0 %	0 %	0 %	203283916
97	NC_011226	TA	3	6	3609	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	203283916
98	NC_011226	TTA	2	6	3676	3681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283916
99	NC_011226	GTA	3	9	3687	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283916
100	NC_011226	TGA	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283916
101	NC_011226	CAATAA	2	12	3776	3787	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203283916
102	NC_011226	A	6	6	3786	3791	100 %	0 %	0 %	0 %	203283916
103	NC_011226	T	6	6	3824	3829	0 %	100 %	0 %	0 %	203283916
104	NC_011226	AGTA	2	8	3830	3837	50 %	25 %	25 %	0 %	203283916
105	NC_011226	ATCA	2	8	3852	3859	50 %	25 %	0 %	25 %	203283916
106	NC_011226	A	6	6	3875	3880	100 %	0 %	0 %	0 %	203283916
107	NC_011226	A	7	7	3917	3923	100 %	0 %	0 %	0 %	203283916
108	NC_011226	TCAAA	2	10	3987	3996	60 %	20 %	0 %	20 %	203283916
109	NC_011226	T	6	6	4004	4009	0 %	100 %	0 %	0 %	203283916
110	NC_011226	TTA	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283916
111	NC_011226	GATA	2	8	4188	4195	50 %	25 %	25 %	0 %	203283916
112	NC_011226	CAAG	2	8	4204	4211	50 %	0 %	25 %	25 %	203283916
113	NC_011226	CAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203283916
114	NC_011226	TTA	3	9	4331	4339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283916
115	NC_011226	AAG	2	6	4447	4452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203283917
116	NC_011226	TAG	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283917
117	NC_011226	ACT	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283917
118	NC_011226	TAT	2	6	4592	4597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283917
119	NC_011226	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283917
120	NC_011226	CT	3	6	4696	4701	0 %	50 %	0 %	50 %	203283917
121	NC_011226	TAG	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283917
122	NC_011226	TA	3	6	4728	4733	50 %	50 %	0 %	0 %	203283917
123	NC_011226	ATA	2	6	4762	4767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283917
124	NC_011226	AAT	2	6	4826	4831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283917
125	NC_011226	TAT	2	6	4841	4846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283917
126	NC_011226	AGA	2	6	4863	4868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203283917
127	NC_011226	GTT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283917
128	NC_011226	AGA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203283917
129	NC_011226	GTT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203283917
130	NC_011226	TAGT	2	8	4964	4971	25 %	50 %	25 %	0 %	203283917
131	NC_011226	AG	3	6	4984	4989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011226	AT	3	6	4998	5003	50 %	50 %	0 %	0 %	203283918
133	NC_011226	TAA	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283918
134	NC_011226	GAT	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283918
135	NC_011226	ATG	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283918
136	NC_011226	GAT	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203283918
137	NC_011226	TAA	2	6	5208	5213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283918
138	NC_011226	GATT	2	8	5319	5326	25 %	50 %	25 %	0 %	203283918
139	NC_011226	T	6	6	5355	5360	0 %	100 %	0 %	0 %	203283918
140	NC_011226	GTAA	2	8	5370	5377	50 %	25 %	25 %	0 %	203283918
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414	NC_011226	GTTT	2	8	14155	14162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
415	NC_011226	T	6	6	14160	14165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_011226	ATTTT	2	10	14173	14182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_011226	T	6	6	14179	14184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_011226	T	9	9	14190	14198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_011226	A	7	7	14223	14229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_011226	A	6	6	14231	14236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_011226	AGG	2	6	14239	14244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
422	NC_011226	AGA	2	6	14247	14252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_011226	A	6	6	14265	14270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011226	TAA	2	6	14290	14295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_011226	TGA	4	12	14308	14319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_011226	GGA	2	6	14334	14339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
427	NC_011226	AGG	3	9	14357	14365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
428	NC_011226	GAG	2	6	14374	14379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
429	NC_011226	TGAG	2	8	14386	14393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
430	NC_011226	AAAG	2	8	14489	14496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
431	NC_011226	AGA	2	6	14549	14554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_011226	AGA	2	6	14558	14563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_011226	GGT	2	6	14586	14591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
434	NC_011226	TCA	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_011226	A	6	6	14609	14614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_011226	TTAA	2	8	14616	14623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_011226	TAAG	2	8	14761	14768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
438	NC_011226	TAG	2	6	14791	14796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_011226	ATA	2	6	14866	14871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_011226	AGG	2	6	14872	14877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
441	NC_011226	ATA	2	6	14899	14904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_011226	ATC	2	6	14948	14953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_011226	GAA	2	6	14964	14969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
444	NC_011226	GAA	2	6	14994	14999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_011226	AGG	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
446	NC_011226	GAT	2	6	15030	15035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.